Optimisation of Xenium automated in situ sequencing for PAXgene-fixed tissue samples
Questo studio presenta un flusso di lavoro ottimizzato che utilizza un nuovo protocollo di digestione basato sulla pepsina (XTO) per adattare con successo la piattaforma automatizzata di sequenziamento in situ Xenium ai tessuti fissati con PAXgene, dimostrando che tali campioni possono ottenere una rilevazione spaziale degli trascritti di RNA paragonabile o superiore ai campioni FFPE standard, preservando al contempo la morfologia tissutale.